Маркизио перешёл в "Зенит" в 2018 году на правах свободного агента после завершения контракта с "Ювентусом". Тот переход случился "на флажке": 31 августа, в последний день трансферного окна. Соглашение было рассчитано до конца сезона-2019/20.
В прошедшем сезоне РПЛ Маркизио сыграл 9 матчей и забил 2 гола – итальянца преследовали травмы, и большую часть года он проходил лечение и реабилитацию.